Moitos cogomelos teñen propiedades medicinais. Por exemplo, no antigo Noso País, as xeadas eran tratadas cun extracto de cogomelos porcini. Os mesmos fungos resultaron ser capaces de bloquear o desenvolvemento de neoplasias malignas. Os impermeables demostraron ser un excelente axente hemostático e antiséptico para cortes e hemorraxias. A esponxa de alerce alivia o estado do paciente durante un ataque asmático e con ictericia, cantarelas e algúns tipos de russula inhiben a reprodución dos estafilococos. E os cogomelos afirman ser un antibiótico natural, así como os champiñóns, que resisten varios tipos de infeccións respiratorias e intestinais. Eles, como os cogomelos, estimulan o sistema inmunitario e melloran o metabolismo dos lípidos.
Algúns tipos de aceite conteñen unha substancia que alivia as dores de cabeza. Ademais, recoméndase o seu uso en ataques de gota, pero o exótico cogomelo shiitake do Extremo Oriente gañou fama como un excelente inmunomodulador. É por iso que se pode mercar non só no supermercado (en bruto), senón tamén na farmacia (en forma de medicamentos). En China e Xapón, estes cogomelos son valorados pola súa capacidade para aumentar a potencia (debido ao seu alto contido en zinc). Non obstante, as persoas que padecen gota e urolitiasis non deben deixarse levar polos cogomelos (especialmente os champiñóns e os porcini), xa que poden provocar unha exacerbación destas enfermidades.